TRÌNH TỰ XƠ NANG VÀ PHÂN LOẠI BIẾN THỂ

Phòng Dịch vụ Xét nghiệm Hợp nhất thực hiện sàng lọc cấp độ hai đối với bệnh Xơ nang sau khi sàng lọc cấp độ một bất thường đối với nồng độ trypsinogen miễn dịch (IRT) tăng cao. Bằng cách giải trình tự gen liên quan đến bệnh Xơ nang (CFTR) và tìm kiếm sự hiện diện của các biến thể đã biết, thường được gọi là đột biến, DCLS có thể xác định trẻ sơ sinh có nguy cơ mắc bệnh Xơ nang cao hơn.

Con tôi được xác định là người mang mầm bệnh xơ nang. Điều này có nghĩa là gì?

Đầu tiên, nếu con bạn được xác định là người có khả năng mang bệnh Xơ nang, trẻ cần được bác sĩ chuyên khoa đánh giá để chính thức xác nhận tình trạng mang bệnh và loại trừ bệnh.

Xơ nang là một rối loạn lặn trên nhiễm sắc thể thường, nghĩa là trẻ bị ảnh hưởng phải nhận được một bản sao gen Xơ nang bị ảnh hưởng từ mỗi cha mẹ. Nếu trẻ sơ sinh chỉ nhận được một bản sao từ cha hoặc mẹ thì trẻ được coi là người mang gen bệnh. Người mang bệnh Xơ nang có nguy cơ truyền bệnh Xơ nang cho con cái trong tương lai cao hơn, vì vậy những người mang bệnh nên gặp chuyên gia tư vấn di truyền khi họ bắt đầu nghĩ đến việc sinh con.

Những biến thể Xơ nang nào được đưa vào sàng lọc?

Bộ phận Dịch vụ Phòng thí nghiệm Hợp nhất (DCLS) sàng lọc hơn 1000 biến thể trong cơ sở dữ liệu CFTR2 được phân loại là “gây ra CF” hoặc “Hậu quả lâm sàng thay đổi”. Một số lần xóa lớn và biến thể phức tạp không được bao gồm trong màn hình DCLS do những hạn chế trong phương pháp thử nghiệm. Để biết danh sách hiện tại các biến thể có trên bảng sàng lọc DCLS, hãy xem tại đây.

Xin lưu ý rằng cơ sở dữ liệu CFTR2 được cập nhật định kỳ khi có bằng chứng lâm sàng và chức năng mới. DCLS giám sát các bản cập nhật này và tích cực hoạt động để xem xét và kết hợp các biến thể mới được phân loại vào xét nghiệm của chúng tôi. Danh sách biến thể được cung cấp ở đây sẽ được cập nhật và các chuyên gia sẽ được thông báo bất cứ khi nào bảng điều khiển DCLS thay đổi.

Phân loại kết quả xét nghiệm Xơ nang của con tôi có ý nghĩa gì?

Bộ phận Dịch vụ Phòng thí nghiệm Hợp nhất (DCLS) dựa vào cơ sở dữ liệu CFTR2 để xác định phân loại của một biến thể. Một biến thể đề cập đến sự thay đổi trong mã di truyền, nhưng không phải tất cả các biến thể đều gây bệnh. Các đặc điểm sau đây và định nghĩa của chúng được gán bởi cơ sở dữ liệu CFTR2 trừ khi có quy định khác. Để biết thêm thông tin về quy trình mô tả đặc tính cơ sở dữ liệu CFTR2, hãy xem tại đây.

  • G@@ ây CF: Một biến thể trong một bản sao của gen CFTR luôn gây ra CF, miễn là nó được ghép nối với một biến thể gây CF khác trong bản sao khác của gen CFTR.
  • Hậu quả lâm sàng khác nhau: Một biến thể CFTR2 có thể gây ra CF, khi được ghép nối với biến thể gây CF trong bản sao khác của gen CFTR.
  • Không gây CF: Một biến thể CFTR2 trong một bản sao của gen CFTR KHÔNG gây ra CF, ngay cả khi nó được ghép nối với biến thể gây CF trong bản sao khác của gen CFTR.
  • Không được phân loại: Một biến thể có thể báo cáo được xác định bởi DCLS không được phân loại trong cơ sở dữ liệu CFTR2. Phân loại biến thể này được cung cấp dưới dạng thông tin bổ sung và nhằm mục đích xem xét bởi nhà cung cấp dịch vụ chăm sóc y tế của bạn.
Con tôi đã nhận được trình tự, nhưng không có biến thể nào được tìm thấy. Điều này có nghĩa là gì?

Quá trình giải trình tự cho bệnh xơ nang cho phép xác định một số biến thể đã biết trước trong gen CFTR. Khi kết quả của " No Variants Found " được báo cáo, điều này cho thấy rằng không có biến thể nào được xác định trước đó được xác định trong gen CFTR của trẻ sơ sinh. Trong giới hạn của màn hình, kết quả này có nghĩa là không có chỉ số nào được biết đến của bệnh xơ nang được phát hiện.

Mục đích của xét nghiệm sàng lọc trẻ sơ sinh là xác định những trẻ sơ sinh có nguy cơ mắc bệnh cao. Việc bổ sung trình tự bậc hai làm tăng tính đặc hiệu của sàng lọc bằng cách quan sát kỹ hơn một nhóm trẻ sơ sinh có nguy cơ cao hơn để lọc ra những trẻ không có đặc điểm di truyền nào được biết đến của một rối loạn.

Những hạn chế của phương pháp giải trình tự bậc hai đối với bệnh Xơ nang là gì?

Quá trình giải trình tự cho bệnh xơ nang xác định một số biến thể đã biết trước trong gen CFTR. Mặc dù giải trình tự có thể phát hiện một danh sách phong phú các biến thể, nhưng nó không thể loại trừ sự hiện diện của tất cả các biến thể xơ nang. Những hạn chế khác đã biết của xét nghiệm giải trình tự sàng lọc sơ sinh xơ nang bao gồm:

  • Các biến thể di truyền can thiệp vào quá trình khuếch đại mục tiêu của bảng thử nghiệm có thể dẫn đến kết quả âm tính giả.
  • Không thể dự đoán giai đoạn phát hiện biến thể nếu không có xét nghiệm của cha mẹ.
  • Thử nghiệm này không bao gồm các biến thể phức tạp hoặc cấu trúc (như các lần xóa/nhân đôi lớn) lớn hơn cơ sở 50.
  • Kết quả không được xác nhận khi sử dụng công nghệ thay thế.

Do những hạn chế đã biết này, bất kể kết quả xét nghiệm sàng lọc là gì, bác sĩ cũng nên đánh giá ngay bất kỳ trẻ sơ sinh hoặc trẻ em nào có biểu hiện các triệu chứng phù hợp với CF.